Conclusion.Complementary approaches

Conclusion.
Complementary approaches in cell biology, biochemistry,
and genetics using cell suspensions and whole plants have permitted
identification of numerous events and proteins or genes
involved in the signaling cascades immediately downstream of
elicitor perception. Much work is still to be done before getting
a general overview of plant defense signaling, including
perception of elicitors, because most of the elicitor binding
sites have not been characterized at the molecular level. The
signal propagation does not follow a simple linear pathway
(e.g., Fig. 1, scheme for cryptogein-induced signaling events)
but, instead, is amplified through a complex network with
many branches, each being controlled by a combination of second
messengers including free calcium, AOS, NO, cytosolic
pH and membrane potential changes, cGMP, cADPR, SA, JA,
ethylene, and probably metabolites of primary metabolism.
Furthermore, the important changes in the pentose phosphate
pathway and the Krebs cycle in the first minutes after elicitor
perception (Pugin et al. 1997), together with the inhibition of
sugar transporters and of mitochondrial activities (Bourque et
al. 2002), are bound to influence cell behavior. However, the
attribution of a defense function to a particular protein or gene
or second messenger is a complex problem whatever the approach
used. For instance, while triggering defense responses,
elicitors also induce abiotic stresses. Indeed, it has very often
been reported that, by changing ion fluxes, elicitors induce
osmotic pressure changes and cell plasmolysis. Thus, by studying
the defense responses triggered by elicitors, we monitored
events and activated or inhibited proteins that are also part of
other signaling pathways. Moreover, not only does crosstalk
between abiotic and biotic stresses occur, but crosstalk between
defense pathways and physiological pathways, including development
and hormone signaling pathways, also occurs (Lam
2004; Lorrain et al. 2003). It also should be taken into account
that the induction of a signaling pathway can trigger its own
negative feedback. For instance, during HR, cells activate or
repress proteins or genes involved in cell survival, and many
genes identified by genetic approaches aimed at identifying
genes involved in the HR are, in fact, negative regulators of
cell death (Tronchet et al. 2001).
Another crucial element that conditions the specificity of the
response is the distribution of second messengers and targeted
proteins in time and space. For instance, the output response of
Ca2+-dependent pathways relies upon the subcellular localization,
lag time, duration, intensity, and frequency of the [Ca]cyt
rise (“calcium signature”). Taking into account the low diffusion
rate of calcium, calcium-responding proteins may be
closely linked to calcium channels localized in both plasma
membranes and calcium internal store membranes, thus building
a complex molecular scaffold able to translate a particular
signal. One indication for the requirement of localized molecular
modules is provided by experiments in which calcium ionophores
were used to mimic elicitor-induced calcium influx. Calcium
ionophores, which deliver Ca2+ independently of cellular
processes and might be randomly incorporated in membranes,
are unable to trigger defense reactions (Tavernier et al. 1995).
Signaling transduction steps relying on second messengers
with short half-lives, such as AOS and NO, should be particularly
dependent on second messenger spatiotemporal production.
In addition, AOS and NO also can combine and act in conjunction
with calcium. Thus, as suggested by different authors,
the complexity of signal integration, together with the amount
of data from different signaling pathways, in different plant
species, and in a wide range of developmental conditions, requires
computer communication systems and models for the
representation and analysis of signal transduction networks
(Genoud and Metraux 1999; Rzhetsky et al. 2000; Trevino
Santa Cruz et al. 2005). Consequently, databases for plant signaling
networks are emerging and will be useful to integrate at
the cellular level the relationships between individual components
that have been identified independently.

Kết quả (Việt) 1:

Kết luận.Các phương pháp bổ sung trong tế bào sinh học, hóa sinh,và di truyền học sử dụng các tế bào bị đình chỉ và toàn bộ cây trồng có thể cho phépnhận dạng của rất nhiều các sự kiện và các protein hoặc các gentham gia trong dãy núi Cascade báo hiệu ngay lập tức về phía hạ lưu củanhận thức elicitor. Nhiều công việc là vẫn phải được thực hiện trước khiTổng quan thực vật bảo vệ tín hiệu, bao gồm cảnhận thức của elicitors, bởi vì hầu hết elicitor ràng buộcCác trang web không có đặc điểm ở cấp độ phân tử. Cáctín hiệu truyền không tuân theo một lộ trình tuyến tính đơn giản(ví dụ như hình 1, chương trình cho các cryptogein gây ra sự kiện tín hiệu)Tuy nhiên, thay vào đó, khuếch đại thông qua một mạng lưới phức tạp vớinhiều nhánh, mỗi người được điều khiển bởi một sự kết hợp lần thứ haisứ giả bao gồm miễn phí canxi, AOS, NO, cytosolicnhững thay đổi tiềm năng pH và màng tế bào, GMP, cADPR, SA, JA,etylen, và có lẽ là chất chuyển hóa của chính sự trao đổi chất.Hơn nữa, những thay đổi quan trọng trong pentose phosphatecon đường và chu trình Krebs năm phút đầu tiên sau khi elicitornhận thức (Pugin et al. năm 1997), cùng với sự ức chế củađường vận chuyển và ti thể hoạt động (Bourque etAl. 2002), chắc chắn sẽ ảnh hưởng đến hành vi của tế bào. Tuy nhiên, cácviệc gán một chức năng phòng thủ một protein đặc biệt hoặc genhoặc messenger thứ hai là vấn đề phức tạp một cách tiếp cận bất cứ điều gìđược sử dụng. Ví dụ, trong khi kích hoạt phản ứng phòng thủ,elicitors cũng gây abiotic nhấn mạnh. Thật vậy, nó đã rất thường xuyênđược báo cáo rằng, bằng cách thay đổi các ion chất, elicitors gây rathay đổi áp suất thẩm thấu và tế bào plasmolysis. Vì vậy, bằng cách nghiên cứuphản ứng quốc phòng được kích hoạt bởi elicitors, chúng tôi theo dõisự kiện và kích hoạt hoặc inhibited protein cũng là một phần củacon đường tín hiệu khác. Hơn nữa, không chỉ làm xuyên âmgiữa căng thẳng abiotic và sinh học xảy ra, nhưng xuyên âm giữabảo vệ con đường và đường sinh lý, bao gồm cả phát triểnvà hormone báo hiệu đường, cũng xảy ra (Lamnăm 2004; Lorrain et al. năm 2003). Nó cũng nên được đưa vào tài khoảnrằng cảm ứng của một con đường tín hiệu có thể kích hoạt riêng của mìnhphản hồi tiêu cực. Ví dụ, trong nhân sự, các tế bào kích hoạt hoặcrepress protein hoặc gen liên quan đến sự sống còn của tế bào, và nhiều ngườigen được xác định bằng phương pháp tiếp cận di truyền nhằm mục đích xác địnhgen liên quan đến nhân sự, trong thực tế, điều chỉnh tiêu cực củatế bào chết (Tronchet et al. năm 2001).Một yếu tố rất quan trọng mà tiết đặc trưng của cácphản ứng là phân phối thứ hai sứ giả và nhắm mục tiêuprotein trong thời gian và không gian. Ví dụ, các phản ứng sản lượng củaCa2 +-phụ thuộc vào con đường dựa vào địa phương hoá của,thời gian chậm trễ, thời gian, cường độ và tần số của cyt [Ca]tăng ("chữ ký của canxi"). Có tính đến sự khuếch tán thấptỷ lệ của canxi, canxi đáp ứng protein có thểchặt chẽ liên kết với canxi kênh địa phương trong cả hai plasmamàng tế bào và canxi màng bên trong cửa hàng, do đó xây dựngmột đài phân tử phức tạp có thể dịch một cụ thểtín hiệu. Một trong những dấu hiệu cho các yêu cầu của bản địa hoá phân tửMô-đun được cung cấp bởi các thí nghiệm trong đó ionophores canxiđược sử dụng để bắt chước canxi gây ra elicitor dòng. Canxiionophores, cung cấp Ca2 + độc lập với di độngxử lý và có thể được kết hợp một cách ngẫu nhiên trong màng tế bào,là không thể kích hoạt phản ứng phòng thủ (Tavernier et al. 1995).Bước dẫn truyền tín hiệu dựa vào thứ hai sứ giảvới ngắn rã, chẳng hạn như AOS và không có, nên đặc biệtphụ thuộc vào thứ hai sản xuất spatiotemporal messenger.Ngoài ra, AOS và không còn có thể kết hợp và hành động kết hợpvới canxi. Vì vậy, theo đề nghị của tác giả khác nhau,sự phức tạp của tín hiệu hội nhập, cùng với số lượngdữ liệu từ các đường tín hiệu khác nhau trong các nhà máy khác nhauloài, và trong một loạt các điều kiện phát triển, đòi hỏiHệ thống thông tin máy tính và các mô hình cho cácđại diện và phân tích các tín hiệu dẫn truyền mạng(Genoud và Metraux năm 1999; Rzhetsky et al. năm 2000; TrevinoSanta Cruz et al. 2005). Kết quả là, cơ sở dữ liệu cho nhà máy truyền tín hiệumạng đang nổi lên và sẽ là hữu ích để tích hợp tạitế bào cấp các mối quan hệ giữa các thành phần riêng lẻmà đã được xác định một cách độc lập.

Kết quả (Việt) 2:

Kết luận.
Phương pháp bổ sung trong sinh học tế bào, hóa sinh,
và di truyền học sử dụng hệ thống treo tế bào và toàn bộ nhà máy đã cho phép
nhận dạng của rất nhiều sự kiện và các protein hoặc các gen
tham gia vào thác hiệu ngay lập tức hạ lưu
niệm elicitor. Phần lớn công việc vẫn phải được thực hiện trước khi nhận được
một cái nhìn tổng quan của tín hiệu vệ thực vật, bao gồm cả
nhận thức của elicitor, bởi vì hầu hết các elicitor ràng buộc
các trang web đã không được mô tả ở cấp độ phân tử. Các
kênh truyền tín hiệu không theo một đường tuyến tính đơn giản
(ví dụ, hình. 1, chương trình cho cryptogein gây ra hiệu sự kiện)
, nhưng thay vào đó, được khuếch đại thông qua một mạng lưới phức tạp với
nhiều nhánh, mỗi nhánh được kiểm soát bởi một sự kết hợp của hai
sứ giả bao gồm miễn phí canxi, AOS, NO, cytosolic
pH và màng thay đổi tiềm năng, cGMP, cADPR, SA, JA,
ethylene, và có lẽ các chất chuyển hóa của sự trao đổi chất cơ bản.
Hơn nữa, những thay đổi quan trọng trong phosphate pentose
đường và chu trình Krebs ở sau elicitor những phút đầu tiên
nhận thức (Pugin et al. 1997), cùng với sự ức chế
vận chuyển đường và các hoạt động của ty lạp thể (Bourque et
al. 2002), đang bị ràng buộc để ảnh hưởng đến hành vi của tế bào. Tuy nhiên, những
quy kết của một chức năng quốc phòng với một loại protein đặc biệt hoặc gen
hoặc truyền tin thứ hai là một vấn đề phức tạp bất cứ phương pháp này
được sử dụng. Ví dụ, trong khi kích hoạt phản ứng phòng thủ,
elicitor cũng gây stress phi sinh học. Thật vậy, nó đã rất thường xuyên
được báo cáo rằng, bằng cách thay đổi các luồng ion, elicitor gây ra
những thay đổi áp suất thẩm thấu và co nguyên sinh tế bào. Như vậy, bằng cách nghiên cứu
các phản ứng phòng thủ kích hoạt bởi elicitor, chúng tôi theo dõi
các sự kiện và các protein kích hoạt hoặc ức chế đó cũng là một phần của
con đường tín hiệu khác. Hơn nữa, không chỉ làm nhiễu xuyên âm
giữa stress phi sinh học và sinh học xảy ra, nhưng nhiễu xuyên âm giữa
các con đường quốc phòng và các con đường sinh lý, bao gồm cả phát triển
và con đường hormone báo hiệu, cũng xảy ra (Lâm
2004; Lorrain et al 2003.). Nó cũng cần được đưa vào tài khoản
mà cảm ứng của một đường tín hiệu có thể kích hoạt riêng của mình
phản hồi tiêu cực. Ví dụ, trong nhân sự, các tế bào kích hoạt hoặc
áp protein hoặc gen liên quan đến sự tồn tại tế bào, và nhiều
gen xác định bằng các phương pháp di truyền nhằm xác định
gen liên quan đến nhân sự, trên thực tế, điều chỉnh tiêu cực của
tế bào chết (Tronchet et al. 2001) .
Một yếu tố rất quan trọng mà điều kiện đặc trưng của
phản ứng là sự phân bố của những sứ giả thứ hai và nhắm mục tiêu
protein trong thời gian và không gian. Ví dụ, những phản ứng đầu ra của
Ca2 + đường -dependent dựa vào nội địa hóa dưới tế bào,
tụt hậu thời gian, thời gian, cường độ và tần số của [Ca] cyt
tăng ( "canxi chữ ký"). Có tính đến sự khuếch tán thấp
tỷ lệ canxi, protein canxi đáp ứng có thể được
liên kết chặt chẽ với các kênh canxi địa phương trong cả plasma
màng và màng canxi cửa hàng nội bộ, do đó xây dựng
một giàn giáo phân tử phức tạp có thể dịch một cụ thể
tín hiệu. Một dấu hiệu cho các yêu cầu của các phân tử nội địa hóa
các module được cung cấp bởi các thí nghiệm trong đó ionophores canxi
được sử dụng để bắt chước elicitor gây ra canxi dòng. Canxi
ionophores, trong đó cung cấp Ca2 + độc lập của tế bào
quy trình và có thể được kết hợp một cách ngẫu nhiên trong màng,
không thể kích hoạt các phản ứng phòng thủ (Tavernier et al. 1995).
Tín hiệu bước truyền dựa trên sứ giả thứ hai
với ngắn nửa cuộc sống, chẳng hạn như AOS và NO , cần phải đặc biệt
phụ thuộc vào sản xuất spatiotemporal tin thứ hai.
Ngoài ra, AOS và NO cũng có thể kết hợp và hành động kết hợp
với canxi. Do đó, theo đề nghị của các tác giả khác nhau,
sự phức tạp của hội nhập tín hiệu, cùng với số tiền
của dữ liệu từ đường dẫn tín hiệu khác nhau, trong thực vật khác nhau
loài, và trong một loạt các điều kiện phát triển, đòi hỏi phải có
hệ thống thông tin máy tính và các mô hình cho các
đại diện và phân tích mạng truyền tín hiệu
(Genoud và Metraux 1999; Rzhetsky et al 2000;. Trevino
santa Cruz et al 2005.). Do đó, cơ sở dữ liệu cho các nhà máy phát tín hiệu
mạng đang xuất hiện và sẽ hữu ích để tích hợp ở
cấp độ tế bào các mối quan hệ giữa các thành phần cá nhân
đã được xác định một cách độc lập.