4.5. Characterisation of community

4.5. Characterisation of community composition
Operational taxonomic units (OTUs) were assigned to the recon-structed read sequences obtained from the root, stem and leaf samples using SILVA rRNA database (http://www.mothur.org/wiki/Silva_reference_files), for the SILVA database we used Silva bacterial reference release 102 (http://www.mothur.org/w/images/9/98/Silva.bacteria.zip). Hence, for the assignment of the OTU we used “splitting by classi-fication” method of the mothur pipeline (http://www.mothur.org/wiki/Cluster.split#method).

Kết quả (Việt) 2:

4.5. Định tính chất của thành phần cộng đồng
các đơn vị phân loại hoạt động (OTUs) đã được giao cho các trình tự đọc Recon-structed thu được từ rễ, thân và mẫu lá sử dụng cơ sở dữ liệu SILVA rRNA (http://www.mothur.org/wiki/Silva_reference_files), cho cơ sở dữ liệu SILVA chúng tôi sử dụng tài liệu tham khảo Silva vi khuẩn phát hành 102 (http://www.mothur.org/w/images/9/98/Silva.bacteria.zip). Do đó, đối với sự phân công của OTU chúng tôi sử dụng "tách theo phân loại-fication" phương pháp của các đường ống dẫn mothur (http://www.mothur.org/wiki/Cluster.split#method).