In fact, although Metschnikowia pul

In fact, although Metschnikowia pulcherrima was isolated at concentrations of 105 cfu ml
1, the amplicon corresponding to this species was not found in the DGGE profiles because it was not targeted by the primers used as hypothesised by the authors. Moreover, Mills et al. (2002) also highlighted the presence of a large population of nonculturable Candida: unlike the other non-Saccharomyces yeasts, the band corresponding to this species occurred in both PCR and RT-PCR-DGGE profiles up to the end of the fermentation process when non-Saccharomyces loads were lower.
Finally, PCR-DGGE analysis of 26S rDNA appeared to be valid also to identify yeasts from samples of raw milk (Cocolin et al., 2002a). At least 13 yeast species could be rapidly identified by PCRDGGE analysis and band sequencing of raw milk samples arising from four different geographical areas of northeastern Italy (Cocolin et al., 2002a).
9. Differentiation, origin assessment, and quality control of food products
PCR-DGGE applied to template DNA directly extracted from a food matrix generates a specific profile of that product in that moment, given the conditions used. The fingerprint gives a ‘‘picture’’ of the microbiota of the product and can be taken into account as a specific trait of that food just like other biochemical, structural, or sensorial properties. PCR-DGGE fingerprinting of food and drinks has been experimented by several authors and, as it turned out, can provide identification of the microbiological trait of food products and may represent a tool for quality control. An original and effective application of PCRDGGE for grouping food products has been recently reported by Mauriello et al. (2003). In this paper, the PCR-DGGE analysis was used for discriminating natural starters for traditional water buffalo Mozzarella cheese production that were sampled from different dairies in southern Italy. The profiles
obtained showed that the microbial composition of the starters was strongly dependent on their geographical origin, with starters from the same area displaying closely related DGGE profiles. Mauriello et al. (2003) also demonstrated that the flavours potentially provided by the development of each starter during curd ripening were absolutely linked to the complexity of the microbial flora shown by DGGE and thus to the geographical origin of the products. This is an important demonstration of the value of the technique in identifying food products on the basis of their origin. Coppola et al. (2001) discriminated between industrial and artisanal pasta filata cheeses by comparing the DGGE profiles of different commercial products. The authors found that PCR-DGGE could better provide the differentiation of the pasta filata cheeses than did the 16S–23S intergenic spacer region analysis of the same products. Cluster analysis of the fingerprints showed that the dairy products grouped according to their microbial complexity and it was found that traditional pasta filata cheeses had profiles very rich in bands and that the
degree of complexity of the microbial flora decreased when the product was of industrial manufacture. On the basis of their results, Coppola et al. (2001) suggested that PCR-DGGE can be considered valid for discriminating traditional and industrial cheeses, also for legal purposes, when products obtained through prescribed manufacturing regulations are analyzed. The potential of PCR-DGGE in differentiating dairy products was further confirmed by Ercolini et al. (2002) by profiling different kinds of cheeses, showing them all to be very different from each other. Unfortunately, it was also demonstrated that different samples of the same category of cheese could display different DGGE profiles (Ercolini et al., 2002), thus compromising the use of
the technique to develop class-specific profiles to be used for cheese classification. PCR-DGGE fingerprinting was also recently used to trace process dynamics during traditional water
buffalo Mozzarella cheese manufacture (Ercolini et al., in press). The analysis of DGGE fingerprints from the intermediate samples during cheese production was shown to be useful to check the natural starter effectiveness and to determine the contribution of different groups of LAB during the fermentation leading to the final Mozzarella cheese.

Kết quả (Việt) 2:

Trong thực tế, mặc dù Metschnikowia pulcherrima được phân lập ở nồng độ 105 cfu ml? 1, các amplicon tương ứng với loài này đã không được tìm thấy trong các cấu DGGE vì nó không được nhắm mục tiêu bởi các mồi sử dụng như là giả thuyết của các tác giả. Hơn nữa, Mills et al. (2002) cũng nhấn mạnh sự hiện diện của một số lượng lớn những nonculturable Candida: không giống như các loại nấm men Saccharomyces không khác, ban nhạc tương ứng với loài này xuất hiện ở cả PCR và RT-PCR-DGGE profiles cho đến cuối quá trình lên men khi không -Saccharomyces tải thấp hơn.
Cuối cùng, phân tích PCR-DGGE của 26S rDNA dường như là hợp lệ cũng để xác định nấm men từ các mẫu sữa nguyên liệu (Cocolin et al., 2002a). Ít nhất 13 loài nấm men có thể được xác định nhanh chóng bởi PCRDGGE phân tích và ban nhạc trình tự của mẫu sữa nguyên liệu phát sinh từ bốn khu vực địa lý khác nhau của vùng đông bắc Italy (Cocolin et al., 2002a).
9. Cách phân biệt, đánh giá nguồn gốc, và kiểm soát chất lượng sản phẩm thực phẩm
PCR-DGGE áp dụng cho các mẫu DNA trực tiếp chiết xuất từ một ma trận thực phẩm tạo ra một hồ sơ cụ thể của sản phẩm đó ở thời điểm đó, đưa ra các điều kiện sử dụng. Các dấu vân tay cho một '' bức tranh '' của các vi sinh vật của sản phẩm và có thể được đưa vào tài khoản như một đặc điểm cụ thể của thực phẩm mà giống như đặc tính sinh hóa, kết cấu, hoặc cảm quan khác. PCR-DGGE thái của những thực phẩm và đồ uống đã được thử nghiệm bởi nhiều tác giả, và khi nó bật ra, có thể cung cấp xác định các đặc điểm vi sinh của sản phẩm thực phẩm và có thể đại diện cho một công cụ để kiểm soát chất lượng. Một ứng dụng ban đầu và hiệu quả của PCRDGGE cho nhóm sản phẩm thực phẩm gần đây đã được báo cáo bởi Mauriello et al. (2003). Trong bài báo này, các phân tích PCR-DGGE đã được sử dụng để phân biệt người mới bắt đầu tự nhiên cho trâu truyền thống sản xuất phô mai Mozzarella được lấy mẫu từ các công ty sữa khác nhau ở miền nam Italy. Các hồ sơ
thu được cho thấy rằng các thành phần vi sinh vật của người mới bắt đầu phụ thuộc rất nhiều vào nguồn gốc địa lý của họ, với người mới bắt đầu từ cùng một khu vực hiển thị hồ sơ DGGE liên quan chặt chẽ. Mauriello et al. (2003) cũng đã chứng minh rằng những hương vị có khả năng cung cấp bởi sự phát triển của mỗi khởi trong sữa đông đã chín hoàn toàn liên quan đến sự phức tạp của hệ vi khuẩn hiện bởi DGGE và do nguồn gốc địa lý của sản phẩm. Đây là một minh chứng quan trọng của các giá trị của kỹ thuật này trong việc xác định các sản phẩm thực phẩm trên cơ sở nguồn gốc của chúng. Coppola et al. (2001) phân biệt đối xử giữa các loại pho mát filata công nghiệp và thủ công pasta bằng cách so sánh các cấu DGGE các sản phẩm thương mại khác nhau. Các tác giả thấy rằng PCR-DGGE có thể cung cấp tốt hơn việc phân biệt các loại pho mát pasta filata hơn đã làm các 16S-23S phân tích vùng đệm intergenic của sản phẩm cùng loại. Phân tích về dấu vân tay cho thấy rằng các sản phẩm sữa được phân nhóm theo độ phức tạp của vi sinh vật của họ và nó đã được tìm thấy rằng pho mát pasta filata truyền thống có cấu hình rất phong phú trong các ban nhạc và các
mức độ phức tạp của hệ vi khuẩn giảm khi sản phẩm đã được sản xuất công nghiệp. Trên cơ sở kết quả của họ, Coppola et al. (2001) cho rằng PCR-DGGE có thể được coi là hợp lệ cho pho mát truyền thống và công nghiệp phân biệt đối xử, cũng cho các mục đích hợp pháp, khi sản phẩm thu được thông qua các quy định sản xuất theo quy định được phân tích. Tiềm năng của PCR-DGGE trong việc phân biệt các sản phẩm sữa được khẳng định thêm bởi Ercolini et al. (2002) bởi profiling các loại khác nhau của các loại pho mát, cho họ thấy tất cả là rất khác nhau từ mỗi khác. Thật không may, nó cũng đã được chứng minh rằng các mẫu khác nhau của cùng một loại pho mát có thể hiển thị hồ sơ DGGE khác nhau (Ercolini et al 2002.,), Do đó ảnh hưởng đến việc sử dụng các
kỹ thuật để phát triển hồ sơ lớp cụ thể sẽ được sử dụng để phân loại pho mát. PCR-DGGE fingerprinting cũng gần đây đã được sử dụng để theo dõi quá trình động lực học trong nước truyền thống
sản xuất pho mát Mozzarella trâu (Ercolini et al., trên báo chí). Việc phân tích DGGE dấu vân tay từ mẫu trung gian trong quá trình sản xuất pho mát đã được chứng minh là hữu ích để kiểm tra tính hiệu quả khởi động tự nhiên và để xác định sự đóng góp của các nhóm khác nhau của LAB trong quá trình lên men dẫn đến các pho mát Mozzarella thức.