In the five lipoylated enzyme compl

In the five lipoylated enzyme complexes, lipoate acts both as
an electrophile that binds to reaction intermediates (via a
thioester or thioether bond) and as a swinging arm that channels
the bound substrate between the active sites of different
subunits (reviewed in references 171, 185, and 187).

-Ketoacid dehydrogenase complexes. All three
-ketoacid
dehydrogenase complexes catalyze the decarboxylation of
-ketoacids
to produce acyl coenzyme A (acyl-CoA), NADH, and
CO2 by similar reaction mechanisms (Fig. 2A). The reaction
begins with the thiamine pyrophosphate (TPP)-dependent decarboxylation
of the substrate catalyzed by the E1 subunit. The
acidic carbon of the TPP thiazole ring attacks the substrate
carbonyl carbon (carbon 2), forming a covalent intermediate.
Collapse of this intermediate releases CO2, leaving an activated
carbanion species bound to TPP. This species acylates
one of the sulfur atoms in lipoamide, leaving the second sulfur
atom reduced to a thiol. The E2 active site then catalyzes the
transfer of the acyl moiety from dihydrolipoamide to coenzyme
A. To regenerate the electrophilic lipoamide form of the cofactor,
the E3 subunit, called a dihydrolipoyl dehydrogenase,
oxidizes dihydrolipoamide to lipoamide in a NAD-dependent
reaction (170). Unlike the E1 and E2 subunits, which are
specific to each
-ketoacid dehydrogenase complex, the E3
subunit is often shared between complexes. For example, in E.
coli the single E3 subunit is encoded in the PDH operon but
can also be expressed from an independent transcript, providing
E3 subunits for the KDH complex (216). In plants (124,
139) and apicomplexan parasites (135), distinct E3 proteins
function in mitochondria and plastids.
AoDH complex. The acetoin dehydrogenase (AoDH) is highly
homologous to PDH and shares all of the features described
above for the
-ketoacid dehydrogenases (256), but it does not
have an
-ketoacid substrate (Fig. 2B). The TPP bound to the
E1 subunit attacks the carbonyl carbon of acetoin (3-hydroxy-
2-butanone), resulting in a covalent linkage between TPP and
2,3-butanediol. This intermediate collapses, releasing acetaldehyde
and leaving TPP with an activated hydroxyethyl group
that is poised to acylate the lipoamide cofactor of the E2
subunit. Other than the release of acetaldehyde (rather than
CO2), the reactions catalyzed by AoDH are identical to those
catalyzed by PDH and result in the formation of acetyl-CoA.
GCV. While other lipoylated complexes irreversibly decarboxylate

-ketoacids to form acyl-CoA moieties, the glycine
cleavage complex (GCV) catalyzes the reversible decarboxylation
of glycine to CO2, NADH, ammonia, and a methylene
group that is bound to tetrahydrofolate (THF) to form
the one-carbon donor 5,10-CH2-THF (Fig. 2C). Thus, although
the reaction sequence of the GCV is similar to that
of the
-ketoacid dehydrogenase complexes, the mechanism
varies from that of other lipoylated complexes in subtle but
important ways.
The subunits of the GCV are known as the P protein (pyridoxal
phosphate-containing protein), H protein (hydrogen
carrier protein), T protein (tetrahydrofolate-containing protein),
and L protein (lipoamide dehydrogenase), with lipoate
covalently bound to the H protein (Fig. 2C) (39).

Kết quả (Việt) 1:

Trong năm tổng hợp enzym lipoylated, lipoate hành vi cả hai như làmột electrophile liên kết với các phản ứng trung gian (thông qua mộttrái phiếu thioester hay Thiôête) và như một swinging arm kênh đóbề mặt bị ràng buộc giữa các trang web hoạt động khác nhausubunits (xem xét trong tài liệu tham khảo 171, 185 và 187).Khu phức hợp của dehydrogenaza - Ketoacid. Tất cả ba - ketoacidkhu phức hợp của dehydrogenaza xúc tác decarboxy - ketoacidsđể sản xuất acyl coenzyme A (acyl-CoA), NADH, vàKhí CO2 bằng cách tương tự như cơ chế phản ứng (hình 2A). Phản ứngbắt đầu với đihiđropyrophotphat Thiamin (TPP)-phụ thuộc decarboxycủa bề mặt xúc tác bởi tiểu đơn vị E1. CácAxít cacbon của TPP thiazole nhẫn tấn công bề mặtcacbonyl cacbon (carbon 2), hình thành một trung cộng hoá trị.Sự sụp đổ này bản phát hành trung bình CO2, để lại một kích hoạtcacbanion loài bị ràng buộc với TPP. Acylates loài nàymột trong các nguyên tử lưu huỳnh trong lipoamide, để lại lần thứ hai lưu huỳnhnguyên tử giảm xuống một sulfhydryl. Trang web hoạt động E2 sau đó catalyzes cácchuyển giao các giống acyl từ dihydrolipoamide coenzymA. để tái tạo các hình thức electrophilic lipoamide cofactor,tiểu đơn vị E3, được gọi là một dihydrolipoyl dehydrogenase,ôxi hóa dihydrolipoamide để lipoamide trong NAD thuoäcphản ứng (170). Không giống như E1 và E2 subunits, đó làcụ thể cho mỗi - ketoacid dehydrogenase phức tạp, E3tiểu đơn vị thường được chia sẻ giữa các tổ hợp. Ví dụ, ở E.coli E3 đơn tiểu đơn vị được mã hóa trong PDH operon nhưngcũng có thể được thể hiện từ một bảng điểm độc lập, cung cấpE3 subunits cho khu phức hợp KDH (216). Trong thực vật (124,139) và apicomplexan ký sinh trùng (135), khác biệt E3 proteinchức năng trong ti thể và plastids.AoDH phức tạp. Axetoin dehydrogenase (AoDH) đánh giá caotương đồng với PDH và chia sẻ tất cả các tính năng được mô tảở trên cho - ketoacid dehydrogenases (256), nhưng nó khôngcó một bề mặt - ketoacid (hình 2B). TPP là ràng buộc để cácE1 tiểu đơn vị tấn công carbonyl carbon của axetoin (3 - hydroxy-2-butanone), kết quả trong một liên kết cộng hóa trị giữa TPP và2,3-butanediol. Này trung gian sụp đổ, phát hành acetaldehydevà để lại TPP với một nhóm hoạt hydroxyethylđó là sẵn sàng để acylate cofactor lipoamide của E2tiểu đơn vị. Khác với việc phát hành của acetaldehyde (thay vìCO2), phản ứng xúc tác bởi AoDH là giống hệt nhau để những ngườixúc tác bởi PDH và kết quả trong sự hình thành của acetyl-CoA.GCV. Trong khi các tổ hợp lipoylated irreversibly decarboxylate-ketoacids để hình thức acyl-CoA moieties, glycinecát khai phức tạp (GCV) catalyzes decarboxy thuận nghịchcủa glycine CO2, NADH, amoniac và một methylenenhóm đó là ràng buộc để tetrahydrofolate (THF) để hình thànhnhà tài trợ một carbon 5,10-CH2-THF (hình 2 c). Vì vậy, mặc dùchuỗi phản ứng GCV là tương tự nhưcủa dehydrogenaza - ketoacid tổng hợp, các cơ chếkhác nhau từ đó của tổ hợp lipoylated khác tại tinh tế nhưngcách quan trọng.Subunits GCV được gọi là protein P (pyridoxalPhân lân có chứa protein), chất đạm H (hydrogentàu sân bay protein), chất đạm T (tetrahydrofolate có chứa protein),và L protein (lipoamide dehydrogenase), với lipoatemột ràng buộc để H protein (hình 2 c) (39).

Kết quả (Việt) 2:

Trong năm hợp enzyme lipoylated, lipoate hoạt động cả hai như là
một electrophile gắn với trung gian phản ứng (thông qua một
thioester hoặc trái phiếu thiôête) và như là một cánh tay đong đưa mà kênh
chất nền ràng buộc giữa các trang web hoạt động khác nhau
tiểu đơn vị (xem xét trong tài liệu tham khảo 171, 185 , và 187).
? phức dehydrogenase -Ketoacid. Tất cả ba? -ketoacid
Phức dehydrogenase xúc tác cho phản ứng khử carboxyl của? -ketoacids
Để sản xuất acyl coenzyme A (acyl-CoA), NADH, và
CO2 bằng cơ chế phản ứng tương tự (Hình. 2A). Phản ứng
bắt đầu với thiamine pyrophosphate (TPP) phản ứng khử carboxyl -dependent
của chất nền xúc tác bởi các tiểu đơn vị E1. Các
carbon có tính axit của các cuộc tấn công vòng thiazol TPP đế
cacbonyl carbon (carbon 2), tạo thành một cộng hóa trị trung gian.
Sự sụp đổ của các phiên CO2 trung gian này, để lại một kích hoạt
loài Cacbanion ràng buộc để TPP. Loài này acylates
một trong các nguyên tử lưu huỳnh trong lipoamide, để lại lưu huỳnh thứ hai
nguyên tử giảm xuống một thiol. Các trang web hoạt động E2 sau đó xúc tác
chuyển giao các phân nưa acyl từ dihydrolipoamide để coenzyme
A. Để tái tạo các hình thức lipoamide electrophin của đồng yếu tố,
các tiểu đơn vị E3, được gọi là dehydrogenase dihydrolipoyl,
ô-xy hóa dihydrolipoamide để lipoamide trong một NAD phụ thuộc vào
phản ứng (170). Không giống như E1 và E2 tiểu đơn vị, đó là
cụ thể cho từng? -ketoacid Phức tạp dehydrogenase, E3
tiểu đơn vị thường được chia sẻ giữa các khu phức hợp. Ví dụ, trong E.
coli các tiểu đơn vị E3 duy nhất được mã hóa trong các operon PDH nhưng
cũng có thể được thể hiện từ một bảng điểm độc lập, cung cấp
E3 tiểu đơn vị cho phức tạp KDH (216). Trong các nhà máy (124,
139) và ký sinh trùng apicomplexan (135), protein E3 biệt
hoạt động trong ty thể và plastid.
AoDH phức tạp. Các dehydrogenase acetoin (AoDH) là rất
tương đồng với PDH và cổ phiếu tất cả các tính năng được mô tả
ở trên cho? Dehydrogenases -ketoacid (256), nhưng nó không
có một? -ketoacid Chất nền (Hình. 2B). TPP ràng buộc với
các cuộc tấn công tiểu đơn vị E1 cacbon cacbonyl của acetoin (3-hydroxy
2-butanone), dẫn đến một liên kết cộng hóa trị giữa TPP và
2,3-butanediol. Điều này trung gian sụp đổ, giải phóng acetaldehyde
và để lại TPP với một nhóm hydroxyethyl kích hoạt
luôn sẵn sàng acylate các cofactor lipoamide của E2
tiểu đơn vị. Khác với việc phát hành của acetaldehyde (chứ không phải
CO2), các phản ứng xúc tác bởi AoDH được trùng với những
xúc tác bởi PDH và dẫn đến sự hình thành của acetyl-CoA.
GCV. Trong khi phức lipoylated khác không thể phục hồi decarboxylate
? -ketoacids Để hình thành các gốc thuốc acyl-CoA, các glycine
phức tạp tách (GCV) xúc tác các phản ứng khử carboxyl hồi
của glycine CO2, NADH, amoniac và methylene
nhóm đó là ràng buộc để tetrahydrofolate (THF) để tạo thành
một trong những nhà tài trợ-carbon 5,10-CH2-THF (Hình. 2C). Như vậy, mặc dù
các chuỗi phản ứng của GCV là tương tự như
của các phức dehydrogenase -ketoacid?, Các cơ chế
khác nhau từ đó của phức lipoylated khác trong tinh tế nhưng
cách quan trọng.
Các tiểu đơn vị của GCV được gọi là protein P (pyridoxal
phosphat -containing protein), H protein (hydrogen
protein vận chuyển), T protein (protein tetrahydrofolate chứa),
và L protein (lipoamide dehydrogenase), với lipoate
đồng hóa trị ràng buộc đối với các protein H 2C (Hình). (39).