There are 150,922 for A. hypogaea (

There are
150,922 for A. hypogaea (including 745 for subsp. fastigiata), 35,291 for A. duranensis, 32,787 for
A. ipaensis, and 6264 for A. stenosperma. Many of the A. hypogaeaESTs have been combined
with short-read sequences to create a first generation transcriptome assembly (NCBI BioProject
PRJNA49471). Before the completion of peanut whole genome sequence, sequencing large numbers
of ESTs can create a formidable resource for studies in both biodiversity and gene-discovery.
Sequence analysis tools have extended the scope of EST utility into the fields of proteomics, marker
development and genome annotation. Although EST collections certainly are not intended to substitute
for a whole genome sequence, the EST resource forms the core foundation for various genome-wide
experiments, particularly for microarray geneexpression study [21,22], marker development and
genetic map construction [17], which will assist assembly of the whole genome. The ESTs will
continue to be actively sequencedto fill knowledge gaps and complement the whole genome sequence.
In spite of the discovery of thousands of microsatellite-containing EST and genomic sequences
from which markers have been developed [23], only ~10–20% detect multiple alleles among tetraploid
peanut genotypes [24-27], although somewhat higher levels of polymorphism have been observed in
several studies [28-32]. In spite of considerable molecular tool expansion for A. hypogaeaover the
past decade, low polymorphism resulting from a genetic bottleneck due topolyploidization [33]
continues to limit the number of markers that can be mapped in populations from intraspecific
biparental crosses.

Kết quả (Việt) 1:

Có 150,922 cho A. hypogaea (bao gồm cả 745 cho phân loài fastigiata), 35,291 cho A. duranensis, 32,787 cho A. ipaensis, và 6264 cho A. stenosperma. Nhiều người trong số các hypogaeaESTs A. đã được kết hợp với ngắn đọc trình tự để tạo ra một thế hệ đầu tiên transcriptome hội (NCBI BioProject PRJNA49471). Trước khi hoàn thành trình tự đậu phộng toàn bộ gen, xác định trình tự số lượng lớn của ESTs có thể tạo ra một nguồn lực ghê gớm cho nghiên cứu đa dạng sinh học và gen-khám phá. Công cụ phân tích trình tự đã mở rộng phạm vi của EST Tiện ích vào các lĩnh vực proteomic, đánh dấu chú thích phát triển và bộ gen. Mặc dù các bộ sưu tập EST chắc chắn không dự định để thay thế cho một chuỗi toàn bộ bộ gen, tài nguyên EST tạo thành nền tảng cốt lõi cho toàn bộ gen khác nhau thí nghiệm, đặc biệt là cho nghiên cứu geneexpression microarray [21,22], đánh dấu sự phát triển và bản đồ di truyền xây dựng [17], mà sẽ hỗ trợ lắp ráp của toàn bộ gen. Sẽ ESTs tiếp tục là tích cực sequencedto điền vào những khoảng trống kiến thức và bổ sung cho dãy toàn bộ bộ gen. Mặc dù sự phát hiện của hàng ngàn có chứa microsatellite EST và trình tự gen từ đánh dấu mà đã là phát triển [23], chỉ có ~ 10-20% phát hiện nhiều alen trong số tetraploid kiểu gen đậu phộng [24-27], mặc dù các cấp độ cao hơn một chút của đa hình đã được quan sát trong một số nghiên cứu [28-32]. Mặc dù công cụ phân tử đáng kể mở rộng cho A. hypogaeaover các trong quá khứ thập kỷ, thấp đa hình kết quả từ một nút cổ chai di truyền do topolyploidization [33] tiếp tục để giới hạn số dấu hiệu có thể được ánh xạ trong các quần thể từ intraspecific đi qua biparental.

Kết quả (Việt) 2:

Có
150.922 cho A. hypogaea (bao gồm 745 cho subsp fastigiata.), 35.291 cho A. duranensis, 32.787 cho
A. ipaensis, và 6264 cho A. stenosperma. Nhiều A. hypogaeaESTs đã được kết hợp
với các chuỗi ngắn đọc để tạo ra một thế hệ đầu tiên transcriptome lắp ráp (NCBI BioProject
PRJNA49471). Trước khi hoàn thành lạc toàn bộ trình tự bộ gen, trình tự số lượng lớn
của ESTs có thể tạo ra một nguồn lực đáng gờm cho các nghiên cứu trong cả đa dạng sinh học và gen khám phá.
Công cụ phân tích trình tự đã mở rộng phạm vi của các tiện ích EST vào các lĩnh vực proteomics, đánh dấu
sự phát triển và chú thích bộ gen . Mặc dù bộ sưu tập EST chắc chắn không nhằm thay thế
cho một chuỗi toàn bộ gen, các nguồn tài nguyên EST hình thành nền tảng cốt lõi cho nhiều genome
thí nghiệm, đặc biệt đối với microarray geneexpression nghiên cứu [21,22], phát triển marker và
xây dựng bản đồ di truyền [17], mà sẽ hỗ trợ lắp ráp toàn bộ hệ gen. Các ESTs sẽ
tiếp tục được tích cực sequencedto điền vào những khoảng trống kiến thức và bổ sung cho các trình tự toàn bộ hệ gen.
Mặc dù sự phát hiện của hàng ngàn microsatellite chứa EST và trình tự bộ gen
mà từ đó các dấu hiệu đã được phát triển [23], chỉ ~ 10-20% phát hiện nhiều alen trong tứ bội
kiểu gen đậu phộng [24-27], mặc dù mức độ có phần cao hơn của tính đa hình đã được quan sát trong
một số nghiên cứu [28-32]. Mặc dù việc mở rộng công cụ phân tử đáng kể cho A. hypogaeaover những
thập kỷ vừa qua, đa hình thấp kết quả từ một nút cổ chai di truyền topolyploidization do [33]
tiếp tục hạn chế số lượng các dấu hiệu có thể được ánh xạ trong các quần thể trong một loài từ
thập biparental.