1.14. Clover material and AFLP appr

1.14. Clover material and AFLP approach

To locate the origin of the cultivated Egyptian clover and trace

its ancestry using AFLP, 30 accessions cultivated accessions

including landraces and varieties of the Egyptian clover and

26 accessions from other eleven related wild species have been

obtained from different sources and areas of the World. AFLP

fragments labeled with fluorescent dye were amplified and sep-
arated using automated DNA sequence machine. Examples of

the AFLP fingerprinting produced by two adapter combina-
tion are given in Fig. 5. Distance trees demonstrating the ge-
netic diversity among the accessions were constructed based

on Dice and Jaccard similarity coefficients using UPGMA

and Neighbor-joining tree building methods with the software

NTSYS-pc 2.1 [56]. In addition, the PAUP software (Swofford

2002) was also used to conduct a parsimony analysis, using heuristic search with MULTREES in effect TBR branch swap-
ping and 100 replicate random additions. Bootstrap values

were calculated for 1000 replicates and plotted onto the strict

consensus tree of 2149 most parsimonious trees.

Kết quả (Việt) 2:

1.14. Clover vật liệu và phương pháp AFLP Để xác định vị trí nguồn gốc của cỏ ba lá Ai Cập trồng và theo dõi tổ tiên của mình sử dụng AFLP, 30 đan có đan có trồng bao gồm các giống và các giống cỏ ba lá Ai Cập và 26 đan có từ mười một loài hoang dã khác liên quan đã được lấy từ các nguồn và các khu vực khác nhau của thế giới. AFLP mảnh dán nhãn với thuốc nhuộm huỳnh quang được khuếch đại và sep- arated sử dụng máy chuỗi DNA tự động. Ví dụ về các fingerprinting AFLP được sản xuất bởi hai bộ chuyển đổi combina- tion được đưa ra trong hình. 5. Cây cách thể hiện bộ gen đa dạng di truyền giữa các đan có được xây dựng dựa trên Dice và Jaccard hệ số tương tự bằng cách sử dụng UPGMA và phương pháp xây dựng cây Neighbor-tham gia với các phần mềm NTSYS-pc 2.1 [56]. Ngoài ra, phần mềm PAUP (Swofford 2002) cũng được sử dụng để tiến hành phân tích sự cẩn thận, sử dụng tìm kiếm heuristic với MULTREES hiệu lực TBR chi nhánh swap- ping và 100 nhân rộng bổ sung ngẫu nhiên. Giá trị bootstrap được tính cho năm 1000 lần nhắc lại, vẽ lên nghiêm ngặt cây đồng thuận của 2149 cây tiêu dùng tiết kiệm nhất.