Gene expression and ChIP datasets w

Gene expression and ChIP datasets with temporal and cellular
resolution would also help to reveal how the organ identity
proteins co-operate with temporally and spatially restricted transcription
factors, and how specific promoter sequences serve
as a platform for these interactions. Fully understanding the
cis-regulatory code would not only explain the spatial patterns
of gene expression during floral organ development, but could
also reveal how the gene expression programmes are organised
temporally. A precedent for this in animal development
is provided by work on PHA-4, which is expressed throughout
the development of the pharynx in Caenorrhabditis elegans and
regulates distinct genes at different stages of pharingeal development.
The stage when a target gene was expressed depended
in part on whether it contained high- or low-affinity binding
sites for PHA-4, with high affinity sites driving earlier expression
[44]. Bioinformatics analysis also revealed binding sites
of other transcription factors that function co-operatively with
the PHA-4 to determine the timing of target gene expression
[45].

Kết quả (Việt) 2:

Biểu hiện gen và bộ dữ liệu ChIP với thời gian tế bào và
độ phân giải cũng sẽ giúp tiết lộ làm thế nào bản sắc organ
protein hợp tác với các phiên mã tạm thời và không gian hạn chế
các yếu tố, và làm thế nào cụ thể trình tự promoter phục vụ
như một nền tảng cho những tương tác này. Hiểu đầy đủ các
mã cis-quy sẽ không chỉ giải thích các mô hình không gian
biểu hiện gen trong quá trình phát triển cơ quan hoa, nhưng có thể
cũng cho thấy làm thế nào các chương trình biểu hiện gen được tổ chức
tạm thời. Một tiền lệ cho điều này trong phát triển chăn nuôi
được cung cấp bởi công việc trên PHA-4, được thể hiện trong suốt
sự phát triển của các họng trong Caenorrhabditis elegans và
quy định các gen khác nhau ở các giai đoạn phát triển khác nhau pharingeal.
Các giai đoạn khi một gen mục tiêu được thể hiện phụ thuộc
một phần vào việc nó chứa cao hoặc có ái lực thấp ràng buộc
các trang web cho PHA-4, với các trang web có ái lực cao lái xe trước đó biểu hiện
[44]. Phân tích tin sinh học cũng tiết lộ vị trí gắn kết
của các yếu tố phiên mã khác có chức năng đồng operatively với
PHA-4 để xác định thời gian biểu hiện gen mục tiêu
[45].