Transcriptomics-Guided Identificati

Transcriptomics-Guided Identification of Lipase Thaps3_264297. To guide identification of prospective targets for knockdown of lipid catabolism, an Affymetrix whole genome tiling microarray of T. pseudonana was analyzed for lipase expression under silicon-limited conditions. Under these conditions, T. pseudonana arrests its cell cycle (23) and accumulates TAG, beginning 8 h after nutrient starvation (Fig. 1A). Transcript abundances were analyzed over a time series of 4, 8, 12, 18, and 24 h after inoculation into silicon-limited media and compared with abundances at hour 0. Of the genes in T. pseudonana containing lipase domains, the gene exhibiting the most consistent decrease in transcript abundance throughout lipid accumulation encoded the predicted hydrolase Thaps3_264297 (Fig. 1A). Sequencing of T. pseudonana cDNA generated from isolated total RNA revealed a 505-amino-acid (aa), 57-kDa protein product.

Kết quả (Việt) 1:

Transcriptomics hướng dẫn xác định Lipase Thaps3_264297. Hướng dẫn xác định các mục tiêu tiềm năng cho knockdown lipid catabolism, một Affymetrix toàn bộ bộ gen ốp lát microarray của T. pseudonana được phân tích cho lipase biểu thức điều kiện hạn chế silic. Dưới những điều kiện này, T. pseudonana bắt giữ chu kỳ tế bào của nó (23) và tích lũy từ khóa, bắt đầu từ 8 h sau dinh dưỡng vì đói (hình 1A). Bảng điểm phát được phân tích trên một dòng thời gian của 4, 8, 12, 18, và 24 h sau khi tiêm chủng vào silicon-TNHH truyền thông và so sánh với phát vào giờ 0. Gen trong T. pseudonana có chứa tên miền lipase, gene trưng bày giảm phù hợp nhất trong học bạ phong phú trong suốt cả sự tích tụ của lipid mã hóa rất dự đoán Thaps3_264297 (hình 1A). Trình tự của T. pseudonana cDNA được tạo ra từ cô lập RNA tất cả tiết lộ một 505 axit amin (aa), 57-kDa protein sản phẩm.

Kết quả (Việt) 2:

Transcriptomics-Guided Xác định Lipase Thaps3_264297. Hướng dẫn xác định các mục tiêu tiềm năng cho rời của lipid dị hóa, một Affymetrix toàn bộ hệ gen ốp lát microarray của T. pseudonana được phân tích biểu hiện lipase trong điều kiện silicon hạn chế. Dưới những điều kiện này, T. pseudonana bắt giữ chu kỳ tế bào của nó (23) và tích lũy TAG, bắt đầu từ 8 giờ sau khi nạn đói dinh dưỡng (Hình. 1A). phong phú bảng điểm đã được phân tích trong một chuỗi thời gian của 4, 8, 12, 18, và 24 giờ sau khi cấy vào môi silicon hạn chế và so sánh với sự phong phú vào giờ 0. Trong số các gen trong T. pseudonana chứa lĩnh lipase, gen trưng bày các giảm phù hợp nhất trong bảng điểm phong phú khắp tích tụ lipid mã hóa các hydrolase dự đoán Thaps3_264297 (Hình. 1A). Trình tự của T. pseudonana cDNA tạo ra từ tổng số RNA bị cô lập đã tiết lộ một 505-amino-acid (aa), sản phẩm protein 57 kDa.