Figure 12.12 Mechanisms of transpos

Figure 12.12 Mechanisms of transposition.(A) “Cut and paste.” A cycle of excision and integration is shown
for Tc3, a member of the Tc1/marinerfamily of DNA transposons. The element is cleaved by the transposase (arrows)
to release the transposon from the flanking host DNA. The transposon DNA remains associated with the transposase,
and the complex then carries out integration at a new TA target site. Because the 5′ cleavage sites are within the
transposon DNA, two bases derived from the 5′ end of the transposon remain at the empty transposon donor site. The
empty donor site is repaired leaving an excision footprint, in which both single-stranded regions are filled in by DNA
polymerase prior to end-joining. The transposon 3′ ends are joined to 5′ protruding ends in the target DNA. Repair of
the resulting gaps completes integration. (Inset) Structure of a Tc1/marinertransposase, showing the DDE motif and
functional regions, and predicted structure of a typical DDE motif. The DDE amino acid residues are shown using
ball-and-stick rendering and the central ball represents the metal ion Mg
2+
. (Adapted with permission from: Lin, T.H.,
Tsai, K.C., Lo, T.C. 2003. Homology modeling of the central catalytic domain of insertion sequence ISLC3isolated
from Lactobacillus caseiATCC 393.Protein Engineering, Design & Selection 16:819– 829. Copyright © 2003, Oxford
University Press.) (B) “Copy and paste.” Retrotransposition of the L1element is depicted. The DNA sequence
encoding an L1element is transcribed into RNA and translated into the L1 proteins ORF1p and ORF2p. The RNA
and proteins form a complex which binds to target DNA. The endonuclease makes a nick in the DNA, generating a
free end. The reverse transcriptase uses this free end as a primer for synthesis of a DNA copy of the L1RNA. The
RNA is degraded (not shown) and the single-stranded DNA copy is used as a template to make double-stranded DNA,
which is then integrated into the target site by DNA cleavage and repair processes. (Redrawn from Bushman, F. (2004)
Nature429:253–255.)

Kết quả (Việt) 1:

Con số 12.12 các cơ chế của transposition.(A) "cắt và dán." Một chu kỳ cắt bỏ và hội nhập Hiển thị
cho Tc3, một thành viên của Tc1/marinerfamily của DNA transposon. Các yếu tố cảm bởi transposase (mũi tên)
để phát hành transposon từ các máy chủ chầu DNA. Transposon DNA vẫn còn liên kết với transposase,
và khu phức hợp sau đó thực hiện tích hợp tại một trang web mục tiêu mới của TA. Bởi vì các trang web cleavage 5 ' trong các
transposon DNA, hai căn cứ xuất phát từ đầu 5 ' của transposon vẫn còn tại chỗ trống transposon nhà tài trợ. Các
chùng rỗng được sửa chữa để lại một dấu chân cắt bỏ, trong đó cả hai khu vực đơn-stranded được điền vào bởi DNA
polymerase trước khi gia nhập kết thúc. Kết thúc 3 ' transposon được gia nhập để 5 ' nhô ra kết thúc trong mục tiêu DNA. Sửa chữa của
những khoảng trống kết quả hoàn thành hội nhập. (Ghép) Cấu trúc của một Tc1/marinertransposase, Đang hiển thị các motif DDE và
vùng chức năng, và dự đoán cấu trúc của một motif DDE điển hình. Dư lượng axit amin DDE sẽ được hiển thị bằng cách sử dụng
bóng thanh vẽ và bóng trung đại diện cho ion kim loại Mg
2
. (Thích nghi với sự cho phép từ: Lin, T.H.,
Tsai, K.C., Lo, T.C. 2003. Tính tương đồng mô hình xúc tác miền trung của chèn chuỗi ISLC3isolated
từ Lactobacillus caseiATCC 393. Protein kỹ thuật, thiết kế & lựa chọn 16:819– 829. Bản quyền © 2003, Oxford
đại học báo chí.) (B) "sao chép và dán." Retrotransposition L1element được mô tả. Trình tự ADN
mã hóa L1element một phiên âm thành RNA và dịch sang các protein L1 ORF1p và ORF2p. RNA
và protein tạo thành một khu phức hợp đó liên kết với mục tiêu DNA. Endonuclease làm cho một nick trong DNA, tạo ra một
miễn phí kết thúc. Reverse transcriptase sử dụng này kết thúc miễn phí như là một mồi cho tổng hợp một bản sao DNA của L1RNA. Các
RNA suy thoái (không hiển thị) và sao chép DNA đơn-stranded được sử dụng như là một bản mẫu để làm cho đôi-stranded DNA,
mà sau đó được tích hợp vào các trang web mục tiêu bởi quá trình cleavage và sửa chữa DNA. (Vẽ lại từ Bushman, F. (2004)
Nature429:253–255.)

Kết quả (Việt) 2:

Hình 12.12 Cơ chế chuyển vị. (A) "Cắt và dán." Một chu kỳ cắt bỏ và hội nhập được hiển thị
cho TC3, một thành viên của Tc1/marinerfamily của transposon DNA. Các yếu tố được phân tách bởi transposase (mũi tên)
để phát hành các transposon từ DNA vật chủ chầu. DNA transposon vẫn còn liên quan đến việc transposase,
và phức tạp sau đó thực hiện hội nhập vào một trang web mục tiêu hỗ trợ kỹ thuật mới. Vì 5 'các trang web chia tách nằm trong
DNA transposon, hai cơ sở có nguồn gốc từ 5 'cuối của transposon ở lại trang web của các nhà tài trợ transposon trống. Các
trang web của nhà tài trợ có sản phẩm nào được sửa chữa để lại một dấu chân cắt bỏ, trong đó cả hai vùng sợi đơn được điền vào bởi DNA
polymerase trước khi kết thúc-tham gia. Transposon 3 'kết thúc được tham gia vào 5' nhô ra đầu trong DNA mục tiêu. Sửa chữa
các lỗ hổng dẫn đến hoàn thành hội nhập. (Inset) Cấu trúc của một Tc1/marinertransposase, cho thấy các motif DDE và
các khu vực chức năng và cấu trúc dự đoán của một motif DDE điển hình. DDE amino acid được hiển thị bằng
vẽ bóng và dính và bóng trung tâm đại diện cho kim loại ion Mg
2 +
. (Trích với sự cho phép từ: Lin, TH,
Tsai, KC, Lo, TC 2003 mô hình tương đồng của miền xúc tác trung tâm của chuỗi chèn ISLC3isolated.
từ Lactobacillus caseiATCC 393.Protein Kỹ thuật, Thiết kế & Lựa chọn 16:819 - 829 Copyright © 2003. , Oxford
University Press.) (B) "Copy và dán." Retrotransposition của L1element được mô tả. Trình tự DNA
mã hóa một L1element được sao chép thành RNA và dịch ra các protein L1 ORF1p và ORF2p. RNA
và protein tạo thành một phức hợp liên kết với mục tiêu DNA. Các endonuclease làm cho một nick trong DNA, tạo ra một
kết thúc miễn phí. Các sao chép ngược sử dụng đầu tự do này như là một mồi để tổng hợp của một bản sao DNA của L1RNA. Các
RNA bị xuống cấp (không hiển thị) và bản sao DNA chuỗi đơn được sử dụng như một khuôn mẫu để làm cho sợi đôi DNA,
mà sau đó được tích hợp vào trang web mục tiêu của sự phân cắt DNA và các quá trình sửa chữa. (Vẽ lại từ Bushman, F. (2004)
Nature429 :253-255.)