amounts of DNA fragments [22]. Cons

amounts of DNA fragments [22]. Considering that qRT-PCR is highly sensitive, real-time qRT-PCR analyses were performed on eight rep- resentative genes, including OsHSP74.8, with specific-primers to validate the changes in mRNA abundance detected by cDNA-AFLP and to quantitatively evaluate the relative abundance of transcripts (Table D.1). These genes were chosen based on their possible func- tions. These genes are likely to be involved in signal transduction (OsRH09), oxidation (OsRH03 and OsRH76), biosynthesis (OsRH62), transport (OsRH05), metabolism (OsRH12), and transcriptional reg- ulation (OsRH27). Expression of these eight genes is shown in Fig. 4. For each transcript, qRT-PCR yielded expression patterns similar to those observed in cDNA-AFLP analysis (Fig. 2). Therefore, the TDFs and their expression profiles obtained using cDNA-AFLP in this study are reliable.

4. Discussion

Variations in gene expression are widespread among individ- uals and taxa. They are somewhat heritable, and they are subject to influence by natural selection and genetic drift. Transcriptome analysis often provides insight into which genes are important to stress adaptation. Because the regulation of gene activity occurs primarily at the transcription level, transcriptome analysis is also a common means of detecting differences in gene expression [23]. In order to identify the genes involved in regulating grain weight in rice exposed to high-temperature stress during the early milky stage, cDNA-AFLP was performed. The differences in gene expression between the heat-sensitive rice line (XN0437S) and the genetically similar heat-tolerant rice line (XN0437T) were ana- lyzed. These lines are the progeny of the same parents and had very similar genomes but they showed significant differences in grain weight after exposure to high-temperature stress [18]. The use of these two rice lines in the present study ensures that the influ- ence of non-target genes will be similar in both and that noise from other parts of the plant genome will be low. The identified genes can

then be correlated to grain weight under high-temperature stress conditions. Finally, 71 TDFs were detected and 54 of these were successfully sequenced. Of the 54 TDFs, 28 were found to be homol- ogous to genes of known function and could thus be categorized by probable functions (Table 1).
An important component of yield in rice is grain weight, which is determined by grain length, grain width, and grain thickness [24]. It is also affected by the environmental factors to which the plant is exposed during the grain filling stage [25,26]. Ever since the advent of molecular marker genetic linkage maps and quantitative trait locus (QTL) analysis approaches, many QTLs for grain weight have been identified in the rice genome [27–34]. In the present study, RILs were used as plant mapping populations and SSR markers were used as mapping markers. TDFs that were shown to co-segregate with one or more markers in all recombinant lines were considered to be in the same linkage group as the markers. Finally, 45 of the
54 identified TDFs were mapped to rice chromosomes and found to be distributed on 9 chromosomes, not including chromosome 5, 9, or 10 (Fig. 3). When the genomic locations of the TDFs mapped in the present study were compared to those of previously reported grain-weight-related QTLs, 12 of the 45 mapped TDFs were found to be very close to those QTLs. OsRH57, OsRH17, OsRH25, and OsRH42 were located near qtgw2, qtgw3b, qtgw7, and qtgw8, respectively, which were reported by Bai et al. [27]. OsRH12 was found near gw8.1, which was reported by Xie et al. [28]. OsRH77 was found near qTGWT-3-1, which was mapped by Zhuang et al. [29]. OsRH45, OsRH38, and OsRH06 were found near Ghd8 [30], qGW4 [31], and qTGW1-1 [32]. OsRH31 was found near qDTY2.2, which has been found to be related to the grain weight of rice exposed to drought

Kết quả (Việt) 1:

số tiền của các mảnh vỡ DNA [22]. Xem xét rằng qRT-PCR là rất nhạy cảm, qRT Đảng Cộng sản Romania thời gian thực phân tích được thực hiện trên tám đại diện - resentative gen, bao gồm cả OsHSP74.8, với lớp lót specific để xác nhận những thay đổi trong phong phú mRNA phát hiện bởi cDNA-GENET và để định đánh giá sự phong phú tương đối của bảng điểm (bảng D.1). Các gen được chọn dựa trên của họ có thể func-tions. Các gen có khả năng được tham gia vào tín hiệu dẫn truyền (OsRH09), oxy hóa (OsRH03 và OsRH76), sinh tổng hợp (OsRH62), giao thông vận tải (OsRH05), trao đổi chất (OsRH12) và transcriptional reg-ulation (OsRH27). Biểu hiện của các gen tám được thể hiện trong hình 4. Đối với mỗi bảng điểm, Đảng Cộng sản Romania qRT mang lại biểu hiện mô hình tương tự như quan sát thấy trong phân tích cDNA-GENET (hình 2). Do đó, các TDFs và profiles biểu hiện của họ thu được bằng cách sử dụng cDNA-GENET trong nghiên cứu này là đáng tin cậy.4. thảo luậnCác biến thể trong biểu hiện gen được phổ biến rộng rãi trong số các individ-uals và đơn vị phân loại. Họ phần nào di truyền, và họ có thể được influence bởi chọn lọc tự nhiên và trôi dạt di truyền. Transcriptome phân tích thường cung cấp cái nhìn sâu sắc vào đó gen là quan trọng để nhấn mạnh thích ứng. Bởi vì các quy định của gen hoạt động xảy ra chủ yếu ở cấp độ sao chép, phân tích transcriptome cũng là một phương tiện phổ biến để phát hiện sự khác biệt trong biểu hiện gen [23]. Để xác định các gien tham gia trong việc điều chỉnh trọng lượng hạt gạo tiếp xúc với nhiệt độ cao căng thẳng trong sữa giai đoạn đầu, cDNA-GENET được thực hiện. Sự khác biệt trong biểu hiện gen giữa dòng nhạy cảm với nhiệt gạo (XN0437S) và tương tự như gen chịu nhiệt gạo dòng (XN0437T) đã là ana-lyzed. Những dòng này là con cháu của các bậc cha mẹ tương tự và có bộ gen rất giống nhau, nhưng họ cho thấy significant sự khác biệt trong hạt trọng lượng sau khi tiếp xúc với nhiệt độ cao căng thẳng [18]. Sử dụng những dòng gạo hai trong nghiên cứu hiện nay đảm bảo rằng ence influ-tiêu gen sẽ được tương tự như trong cả hai và rằng tiếng ồn từ các bộ phận khác của bộ gen thực vật sẽ được thấp. Identified gen có thể sau đó được tương quan đến trọng lượng hạt điều kiện căng thẳng nhiệt độ cao. Cuối cùng, 71 TDFs được phát hiện và 54 của những thành công đã được trình tự. 54 TDFs, 28 đã được tìm thấy là homol-ogous để gen của chức năng được biết đến và do đó có thể được phân loại theo chức năng có thể xảy ra (bảng 1).Một thành phần quan trọng của năng suất trong gạo là trọng lượng hạt, được xác định bởi hạt chiều dài, chiều rộng hạt, và hạt dày [24]. Nó cũng bị ảnh hưởng bởi các yếu tố môi trường mà nhà máy được tiếp xúc trong giai đoạn filling hạt [25,26]. Kể từ khi sự ra đời của phân tử đánh dấu di truyền liên kết bản đồ và định lượng đặc điểm locus (QTL) phân tích phương pháp tiếp cận, nhiều QTLs cho trọng lượng hạt đã là identified trong bộ gen gạo [27-34]. Trong nghiên cứu hiện nay, RILs đã được sử dụng như là thực vật bản đồ quần thể và SSR đánh dấu được sử dụng như lập bản đồ đánh dấu. TDFs đã được hiển thị để đồng phân biệt với một hoặc nhiều dấu hiệu trong tất cả tái tổ hợp dòng được coi là để trong nhóm liên kết tương tự như các dấu hiệu. Cuối cùng, 45 của các54 identified TDFs đã được ánh xạ tới gạo nhiễm sắc thể và tìm thấy sẽ được phân phối trên nhiễm sắc thể 9, không bao gồm nhiễm sắc thể 5, 9 hay 10 (hình 3). Khi các địa điểm gen của TDFs ánh xạ trong nghiên cứu hiện nay đã được so sánh với những người trước đây báo cáo liên quan đến hạt-trọng lượng QTLs, 12 được ánh xạ TDFs 45 đã được tìm thấy là rất gần với những QTLs. OsRH57, OsRH17, OsRH25, và OsRH42 đã nằm gần qtgw2, qtgw3b, qtgw7, và qtgw8, tương ứng, mà đã được báo cáo bởi Bai et al. [27]. OsRH12 đã được tìm thấy gần gw8.1, mà đã được báo cáo bởi Xie et al. [28]. OsRH77 đã được tìm thấy gần qTGWT-3-1, được ánh xạ bởi Choang et al. [29]. OsRH45, OsRH38, và OsRH06 đã được tìm thấy gần Ghd8 [30], qGW4 [31], và qTGW1-1 [32]. OsRH31 đã được tìm thấy gần qDTY2.2, đã được tìm thấy có liên quan đến trọng lượng hạt gạo tiếp xúc với hạn hán

Kết quả (Việt) 2:

lượng của các mảnh ADN [22]. Xét rằng QRT-PCR là rất nhạy cảm, thời gian thực QRT-PCR phân tích được thực hiện trên tám gen resentative của đại diện, bao gồm cả OsHSP74.8, với fi Speci c-mồi để xác nhận các thay đổi trong mRNA phong phú được phát hiện bởi cDNA-AFLP và đánh giá định lượng sự phong phú tương đối của bảng điểm (Bảng D.1). Những gen này đã được lựa chọn dựa trên các chức năng có thể của họ. Những gen này có thể sẽ được tham gia vào việc truyền tín hiệu (OsRH09), quá trình oxy hóa (OsRH03 và OsRH76), sinh tổng hợp (OsRH62), vận tải (OsRH05), sự trao đổi chất (OsRH12), và ulation reg- phiên mã (OsRH27). Biểu hiện của tám gen được thể hiện trong hình. 4. Đối với mỗi bảng điểm, QRT-PCR thu được mô hình biểu hiện tương tự như quan sát thấy trong cDNA-AFLP phân tích (Hình. 2). Vì vậy, các TDFs và biểu hiện của họ pro fi les thu được sử dụng cDNA-AFLP trong nghiên cứu này là đáng tin cậy. 4. Thảo luận Những biến đổi trong biểu hiện gen là phổ biến trong các uals individ- và nhóm loài. Họ đang có một số di truyền, và họ phải chịu trong uence fl của chọn lọc tự nhiên và trôi dạt di truyền. Phân tích transcriptome thường cung cấp cái nhìn sâu sắc vào những gen nào là quan trọng để nhấn mạnh sự thích nghi. Bởi vì các quy định về hoạt động gen xảy ra chủ yếu ở mức độ phiên mã, phân tích transcriptome cũng là một phương tiện phổ biến để phát hiện sự khác biệt trong biểu hiện gen [23]. Để xác định các gen liên quan trong việc điều chỉnh trọng lượng hạt lúa trong tiếp xúc với stress nhiệt độ cao trong giai đoạn sữa sớm, cDNA-AFLP được thực hiện. Sự khác biệt trong biểu hiện gen giữa các dòng nhạy nhiệt gạo (XN0437S) và các dòng lúa chịu nhiệt tương tự gen (XN0437T) đã ana lyzed. Những dòng này là con cháu của các bậc phụ huynh cùng và có hệ gen rất giống nhau nhưng họ đã cho thấy sự khác biệt trọng yếu về trọng lượng hạt sau khi tiếp xúc với nhiệt độ cao căng thẳng [18]. Việc sử dụng hai dòng lúa trong nghiên cứu này đảm bảo rằng trong fl u- kinh của các gen không phải mục tiêu sẽ tương tự trong cả hai và rằng tiếng ồn từ các bộ phận khác của hệ gen của cây sẽ là thấp. Các gen fi ed identi có thể sau đó được tương quan với trọng lượng hạt trong điều kiện căng thẳng ở nhiệt độ cao. Cuối cùng, 71 TDFs đã được phát hiện và 54 trong số đó được giải mã thành công. Trong số 54 TDFs, 28 đã được tìm thấy là homol- ogous gien của chức năng được biết và do đó có thể được phân loại theo chức năng có thể xảy ra (Bảng 1). Một thành phần quan trọng của năng suất lúa là trọng lượng hạt, được xác định bởi chiều dài hạt, ngũ cốc chiều rộng, và ngũ cốc dày [24]. Nó cũng bị ảnh hưởng bởi các yếu tố môi trường mà nhà máy được tiếp xúc trong giai đoạn hạt fi lling [25,26]. Kể từ sự ra đời của marker phân tử bản đồ liên kết di truyền và đặc điểm locus định lượng (QTL) Phương pháp phân tích, nhiều QTLs cho trọng lượng ngũ cốc đã được identi fi ed trong hệ gen của lúa [27-34]. Trong nghiên cứu này, RILs được sử dụng như quần thể thực vật và lập bản đồ đánh dấu SSR được sử dụng như là dấu hiệu bản đồ. TDFs đã được chứng minh là đồng phân ly với một hoặc nhiều dấu trong tất cả các dòng tái tổ hợp được coi là trong các nhóm liên kết tương tự như các dấu. Cuối cùng, 45 của TDFs 54 identi fi ed được ánh xạ tới các nhiễm sắc thể lúa và phát hiện được phân phối trên 9 nhiễm sắc thể, không bao gồm NST số 5, 9, hoặc 10 (Hình. 3). Khi các địa điểm di truyền của TDFs ánh xạ trong nghiên cứu này được so sánh với những QTLs hạt trọng liên quan đến báo cáo trước đó, 12 trong số 45 ánh xạ TDFs đã được tìm thấy là rất gần gũi với những QTLs. OsRH57, OsRH17, OsRH25, và OsRH42 được nằm gần qtgw2, qtgw3b, qtgw7, và qtgw8, tương ứng, mà đã được báo cáo bởi Bai et al. [27]. OsRH12 được tìm thấy gần gw8.1, được báo cáo bởi Xie et al. [28]. OsRH77 được tìm thấy gần qTGWT-3-1, được ánh xạ bởi Zhuang et al. [29]. OsRH45, OsRH38, và OsRH06 được tìm thấy gần Ghd8 [30], qGW4 [31], và qTGW1-1 [32]. OsRH31 được tìm thấy gần qDTY2.2, đã được tìm thấy có liên quan đến trọng lượng hạt gạo tiếp xúc với hạn hán